- Антарктика,
- бактерії роду Pseudomonas,
- сиквенс 16S рРНК
Анотація
Із зразків грунту, моху і донних відкладень, відібраних на островах Галіндез, Пітерман і Десепшн, було виділено 59 штамів бактерій роду Pseudomonas. Дослідження цих культур за 113 фенотиповими ознаками та результати ідентифікації за допомогою комп’ютерної програми дозволили віднести 25 штамів до V біовару P. fluorescens, 22 – до біоварів А і В P.putida, 2 – до P. alcalifila. Дані сиквенсу гіперваріабельної ділянки гена 16S рРНК та фенотипового аналізу дозволили віднести 8 антарктичних ізолятів до P. fragi і P. veronii і показали приналежність 2-х неідентифікованих штамів псевдомонад до P. Fluorescens-комплексу. Одержані дані свідчать про те, що мікробіота Антарктики представлена як широко розповсюдженими, так і специфічними, можливо, новими видами псевдомонад.
Посилання
- Anzai, Y., Kim, H., Park, J.Y., Wakabayashi, H., & Oyaizu, H. (2000). Phylogenetic affiliation of the pseudomonas based on 16S rRNA sequence. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 50(4), 1563–1589.
- Bowman, J.P., McCammon, S.A., Brown, M.V., Nichols, D.S., & McMeekin, T.A. (1997). Diversity and Association of psychrophilic bacteria in Antarctic sea ice. Appl. Environ. Microbiol., 63(8), 3068–3078.
- Obata, H., Muryoi, N., Kawahara, H., Yamade, K., & Nishikawa, J. (1999). Identification of a novel ice-nucleating bacterium of Antarctic origin and its ice nucleation properties. Cryobiology, 38, 131–139.
- Smirnov, V.V., & Kiprianova, E.A. (1990). Bakterii roda Pseudomonas. [Bacteria of the genus Pseudomonas]. Kyiv. Naukova dumka. pp. 220–230.
- Koczoflyak, O.I., Reva, O.N., Kiprianova, E.A., & Smirnov, V.V. (2003). Identifikaciya bakterij roda Pseudomonas metodami komp`yuternogo analiza. [Identification of bacteria of the genus Pseudomonas by computer analysis methods]. Mikrobiol. Zhurn., 65(6), 3–12.